Als Böhme seine Schrift "Morgenröte im Aufgang" (1612), in der er seine mystischen Erfahrungen festhielt und über Gott meditierte, veröffentlichte - hatte ein einfacher Handwerker gegen die herrschende Ideologie der Kirche verstoßen. Die kirchlichen und bürgerlichen Autoritäten der Stadt Görlitz verurteilten seine Schriften als ketzerisch. Nachdem er nach Dresden geflohen war, bescheinigte man ihm dort seine Unschuld und gestattete ihm, nach Görlitz zurückzukehren.

Zu seinen bekanntesten Werken zählen "Von den drei Prinzipien des göttlichen Wesens" (1619) sowie "Der Weg zu Christo" (1624). Böhme ging von dem dualistischen Grundprinzip aus, dass jedes Ding nur durch sein Gegenteil existiert und erfahrbar ist. In diesem Sinne ist das Böse ein unverzichtbarer Bestandteil des Guten, denn ohne das Böse gäbe es auch keinen Ansporn zu seiner Überwindung und damit kein Streben nach höheren Werten. Nach Böhmes Auffassung wohnen der göttliche Natur selbst widersprüchliche Elemente inne. Seine religiösen Ideen beeinflussten sowohl Theologen als auch Philosophen der westlichen Moderne. Da er erstmals philosophische Schriften in deutscher Sprache veröffentlichte, wurde er "Philosophus Teutonicus" genannt.

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